23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1207 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  42 
 
 		 200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  41.46 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  27.36 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  27.41 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  25.13 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  27.12 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  25.68 
 
 		 164 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  22.96 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  27.56 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  41.3 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>