26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1966 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  41.89 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  32.12 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  36.27 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  30.93 
 
 		 191 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  34 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  34.01 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  91.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  32.5 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  30.92 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  25.91 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  28.28 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  28.43 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.5 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  25.17 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  29.55 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  29.05 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  25.52 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  28.8 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>