27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1890 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  353  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  51.22 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  36.08 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  37.65 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  38.51 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  31.96 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  37.96 
 
 		 193 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 191 aa  91.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  30.35 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 229 aa  88.2  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  34.75 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  30.39 
 
 		 198 aa  84  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  34.97 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  32.09 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  35.11 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  27.11 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  27.27 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  31.5 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  28.57 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  25.45 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  26.52 
 
 		 200 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>