25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5080 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  36.88 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  32.73 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  35.52 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  88.6  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  34.39 
 
 		 193 aa  87.8  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  31.07 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  30.57 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  29.66 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  26.56 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  25.74 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  33.85 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  23.35 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  27.85 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  21.36 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  25.53 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  28.68 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  25.35 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  27.46 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>