24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0420 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  41.46 
 
 
214 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  38.74 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  31.51 
 
 
220 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  31.58 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  36.11 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  34.35 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  32 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  36.55 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  35.38 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  30.21 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  33.86 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  34.51 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  29.8 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  30.68 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  25.82 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  29.2 
 
 
164 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  31.5 
 
 
171 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  28.57 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>