30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4950 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  45.37 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  42.17 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  40.57 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  41.04 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  41.4 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  41.98 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  39.81 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  36.82 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  37.44 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  37.33 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  40.09 
 
 		 193 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  39.23 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  31.96 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  30.46 
 
 		 164 aa  95.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  35.07 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  30.36 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.7 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  30.58 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  30.33 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  30.63 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.21 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.52 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  31.46 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  28.11 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  48.5  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  43.18 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>