22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0229 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  59.91 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  57.08 
 
 		 228 aa  238  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  53.85 
 
 		 205 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.7 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  33.17 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  33.82 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  35.09 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  31.4 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  33.63 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  29.59 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  30.61 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  25.64 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  30.43 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  29.81 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  25.38 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.6 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  27.23 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  24.88 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  30.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.03 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>