41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0438 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  98.76 
 
 
242 aa  497  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.7 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  33.62 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  37.04 
 
 
252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  35.59 
 
 
273 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.56 
 
 
246 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.57 
 
 
238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  33.62 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  32.33 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  31.39 
 
 
262 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.8 
 
 
245 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  30.18 
 
 
268 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.31 
 
 
245 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.6 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.22 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  35.54 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.12 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  35.54 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.93 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  34.22 
 
 
252 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  32.37 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  30.67 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.56 
 
 
246 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.56 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.56 
 
 
248 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.44 
 
 
245 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  32.77 
 
 
262 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  34.95 
 
 
233 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  36.81 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  34.9 
 
 
242 aa  99.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  33.9 
 
 
361 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  30.82 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  31.17 
 
 
250 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  29.53 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  29.81 
 
 
211 aa  47  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  27.62 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.36 
 
 
217 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  25.17 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 
755 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  30.63 
 
 
219 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>