53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2016 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 238 aa  493  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.8 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  50.61 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.22 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  50.41 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.41 
 
 		 246 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  50.41 
 
 		 263 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  55.84 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.21 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  50.62 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  47.15 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  51.3 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  50.43 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.84 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.12 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.09 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.08 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.32 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.31 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  47.08 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.19 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.08 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  44.44 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  44.83 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  46.24 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  40.54 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  39.2 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  32.77 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  34.57 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  35.93 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  39.78 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  35.39 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  32.29 
 
 		 361 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  33.78 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  28.19 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 		 755 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  24.54 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  27.75 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  26.19 
 
 		 217 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  28.86 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  25.29 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  30.69 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  30.69 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  30.69 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  25.84 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  26.22 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  25.9 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  26.14 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  24.1 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  22.83 
 
 		 219 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  22.28 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  25.37 
 
 		 164 aa  42  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>