42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5468 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  32.64 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  34.05 
 
 		 220 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  33.87 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  31.72 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  27.55 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  31.13 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  27.88 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  27.88 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  27.88 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  30.69 
 
 		 475 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  28.7 
 
 		 219 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  29.03 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  28.86 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  32.8 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  31.79 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.91 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.13 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.99 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.63 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  25.71 
 
 		 273 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.81 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  25.65 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.29 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  23.66 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.44 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.42 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.04 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  26.04 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.44 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  26.35 
 
 		 262 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.04 
 
 		 251 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  25.29 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  26.35 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  27.22 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  26.35 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  27.38 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.04 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  23.46 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>