19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0417 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  79.02 
 
 
221 aa  337  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  60.09 
 
 
213 aa  250  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  55.98 
 
 
220 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  58.1 
 
 
218 aa  227  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  53.64 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  58.46 
 
 
216 aa  207  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  55.38 
 
 
219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  55.9 
 
 
219 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  51.28 
 
 
280 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  51.28 
 
 
280 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  51.28 
 
 
280 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  48.47 
 
 
218 aa  184  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  35.2 
 
 
200 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  37.76 
 
 
244 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  32.8 
 
 
210 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  35.86 
 
 
475 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.11 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 
263 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>