25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7244 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  54.33 
 
 
220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  51.67 
 
 
217 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  49.28 
 
 
213 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  52.4 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  51.23 
 
 
219 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  50.74 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  42.54 
 
 
280 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  42.54 
 
 
280 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  42.54 
 
 
280 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  46.19 
 
 
221 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  48.47 
 
 
224 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  42.58 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  35.45 
 
 
244 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  28.8 
 
 
200 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  27.55 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.71 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.69 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  31.68 
 
 
262 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.51 
 
 
246 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  26.51 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  26.51 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  24.4 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  25.48 
 
 
475 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>