219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0665 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  100 
 
 
475 aa  905    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0758  alpha/beta hydrolase fold  41.86 
 
 
253 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.294799  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 
255 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  30.69 
 
 
210 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.5 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  31.67 
 
 
387 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  32.78 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  39.31 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  33.13 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  35.22 
 
 
220 aa  67  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  30.81 
 
 
218 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  35.86 
 
 
219 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0856  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
237 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000204036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  39.02 
 
 
221 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
255 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
264 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  31.65 
 
 
216 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
255 aa  60.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 
245 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
264 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3574  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
244 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130291  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  35.29 
 
 
280 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  35.59 
 
 
280 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  35.29 
 
 
280 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  29.31 
 
 
217 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  34.54 
 
 
224 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 
286 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
389 aa  57  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
327 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  28.35 
 
 
277 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
271 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.08 
 
 
264 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  25.45 
 
 
230 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4075  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
272 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
299 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
237 aa  54.3  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  23.79 
 
 
304 aa  54.3  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 
310 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
256 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.88 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  37.36 
 
 
265 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2099  thioesterase  26.09 
 
 
239 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759649  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  28.97 
 
 
256 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
261 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0632  putative hydrolse  24.07 
 
 
273 aa  52.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0784217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
265 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 
269 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
256 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.92 
 
 
296 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  37.63 
 
 
265 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
309 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
268 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
264 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9504  alpha/beta hydrolase protein  36.67 
 
 
272 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 
279 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
264 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
265 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  25.46 
 
 
315 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  25.46 
 
 
315 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3013  acyl-CoA thioester hydrolase YfbB  27.11 
 
 
263 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 
304 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 
258 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
259 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.931775  hitchhiker  0.0000130442 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 
277 aa  49.7  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
236 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
345 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  28.24 
 
 
328 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
256 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
237 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  25.48 
 
 
265 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  29.22 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2945  alpha/beta hydrolase fold  43.48 
 
 
290 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86812  predicted protein  26.77 
 
 
312 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
234 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
252 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  29.84 
 
 
244 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
253 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
397 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5689  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
280 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0414771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  28.98 
 
 
4186 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
268 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  29.27 
 
 
249 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2076  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
268 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.484509 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  22.52 
 
 
260 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.36 
 
 
278 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
275 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4425  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
321 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
299 aa  47.4  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
275 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4512  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
321 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
275 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4806  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
321 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786039  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  24.15 
 
 
310 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>