32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6388 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  75.47 
 
 		 217 aa  335  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  60.58 
 
 		 213 aa  262  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  54.33 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  56.04 
 
 		 216 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  55.98 
 
 		 224 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  56.1 
 
 		 219 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  56.1 
 
 		 219 aa  216  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  52.61 
 
 		 218 aa  215  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  54.07 
 
 		 221 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  47.6 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  47.6 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  47.6 
 
 		 280 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  34.38 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  37.11 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  34.05 
 
 		 210 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  35.22 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.29 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.75 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  26.35 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  26.35 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27.54 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  27.11 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.61 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.67 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.35 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.9 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  26.47 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  28.14 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25 
 
 		 245 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.3 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5252  putative signal peptide  27.88 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  decreased coverage  0.00344159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>