17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3684 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  37.63 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  36 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  38.66 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  35.45 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  36.41 
 
 
213 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  34.67 
 
 
218 aa  106  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  32.33 
 
 
280 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  32.33 
 
 
280 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  32.33 
 
 
280 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  31.12 
 
 
200 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  37.76 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  36.22 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  34.18 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  35.61 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  31.79 
 
 
210 aa  79  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  29.84 
 
 
475 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>