38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2086 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  79.02 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  60.56 
 
 		 213 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  56.67 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  53.92 
 
 		 217 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  54.07 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  51.29 
 
 		 280 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  51.29 
 
 		 280 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  51.29 
 
 		 280 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  46.19 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  53.85 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  51.79 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  50.77 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  39.18 
 
 		 244 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  32.84 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  29.03 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  43.7 
 
 		 475 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.09 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.74 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  28.81 
 
 		 236 aa  52  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  28.22 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.06 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  27.27 
 
 		 233 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  25.9 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.81 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.22 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  25.9 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  26.83 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.04 
 
 		 245 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.06 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  24.85 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  25.81 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.06 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.06 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.6 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  25.44 
 
 		 263 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  24.48 
 
 		 187 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  25.44 
 
 		 263 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>