44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1165 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  61.7 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60.53 
 
 		 263 aa  245  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  58.29 
 
 		 262 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  58.76 
 
 		 268 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  58.76 
 
 		 263 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  58.76 
 
 		 263 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.76 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  57.21 
 
 		 245 aa  238  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.95 
 
 		 245 aa  238  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  56.04 
 
 		 238 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  56.04 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  58.33 
 
 		 248 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  58.64 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.49 
 
 		 245 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.4 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  54.08 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  53.11 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  57.07 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  50.5 
 
 		 273 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.19 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  52.79 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.16 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 252 aa  161  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  44.85 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  37.37 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  35.98 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  34.63 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  37.08 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  32.16 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  33.52 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  38.25 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  32.02 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  30.65 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  29.23 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  26.42 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  26.09 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  26.58 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 755 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  25.42 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  25.61 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  25.15 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  24.05 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>