51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2976 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  97.06 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  76.76 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60.33 
 
 		 245 aa  301  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.78 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  56.68 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  56.45 
 
 		 248 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  56.73 
 
 		 246 aa  287  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.6 
 
 		 246 aa  275  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  53.59 
 
 		 262 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.46 
 
 		 263 aa  261  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  54.36 
 
 		 268 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.5 
 
 		 245 aa  258  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.69 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  53.69 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  53.69 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.79 
 
 		 239 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  51.25 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.57 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  57.58 
 
 		 217 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.35 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  45.87 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  43.33 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  45.95 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  47.8 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  41.33 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  32.33 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  32.33 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  38.86 
 
 		 361 aa  124  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  37.8 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  31.39 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  38.46 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  33.55 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  33.49 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.12 
 
 		 755 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  29.7 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  26.53 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.44 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  26.35 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  25.9 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  27.38 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25.12 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  24.55 
 
 		 213 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  33.91 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  23.67 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>