36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5398 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  50.6 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  39.29 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  35.05 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  30.67 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  34.24 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.36 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  30.25 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.51 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  30.25 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.25 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  31.48 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.1 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  31.78 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  32.38 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.13 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.45 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  29.05 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  31.53 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.32 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.01 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  31.48 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.02 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  28.76 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  27.45 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  32.24 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  25.25 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.15 
 
 		 755 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>