39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1313 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  724    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  38.54 
 
 		 252 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  33.73 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  38.86 
 
 		 238 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.06 
 
 		 245 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  38.86 
 
 		 238 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  37.11 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.5 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.14 
 
 		 246 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.46 
 
 		 245 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.94 
 
 		 248 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.94 
 
 		 246 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.42 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  34.65 
 
 		 233 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.75 
 
 		 239 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  34.38 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.94 
 
 		 246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  35.94 
 
 		 263 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  35.94 
 
 		 263 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  35.42 
 
 		 262 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  31.3 
 
 		 252 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.16 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.73 
 
 		 217 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  34.38 
 
 		 268 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.38 
 
 		 245 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.64 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  33.9 
 
 		 242 aa  96.7  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  29.39 
 
 		 236 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  33.9 
 
 		 242 aa  96.3  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  31.5 
 
 		 262 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  28.5 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  27.45 
 
 		 250 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  25.71 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  30.37 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  27.75 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  21.67 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.79 
 
 		 755 aa  43.9  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  37.93 
 
 		 182 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2983  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  42.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>