48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4094 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  82.07 
 
 		 251 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  49.41 
 
 		 262 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  42.91 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.61 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  49.61 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  49.61 
 
 		 263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.46 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  49 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.09 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.39 
 
 		 246 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.42 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  48.95 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.99 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.38 
 
 		 246 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.61 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.12 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.92 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.21 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1165  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.79 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0086  hypothetical protein  45.64 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  45.8 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  45.87 
 
 		 238 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4243  twin-arginine translocation pathway signal  43.69 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  41.53 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  40.64 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0229  hypothetical protein  37.1 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33660  dehydrogenase small subunit  39.55 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.563663  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  34.22 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  33.69 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1597  hypothetical protein  34.06 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1313  hypothetical protein  31.3 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5398  hypothetical protein  31.72 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3896  hypothetical protein  39.63 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.185308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  33.87 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  27.16 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  28.99 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  25.65 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  28.22 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.78 
 
 		 755 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  26.63 
 
 		 213 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  30.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  30.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  30.39 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0110  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  25 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  25.23 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  31.25 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  26.76 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>