38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2789 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  45.41 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  44.76 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  50.99 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.7 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  29.82 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.54 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  25.84 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.54 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  26.42 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  29.47 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4382  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.99 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  25.45 
 
 		 273 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35300  hypothetical protein  25.94 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.381438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  28.41 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2564  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.49 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0228  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.67 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  25.84 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2561  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25 
 
 		 248 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3384  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25.73 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.515612 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  29.86 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  25.54 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4640  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.3 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.833906  normal  0.885196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1794  hypothetical protein  25.15 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.653349  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  29.03 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2375  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  25.94 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3294  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.15 
 
 		 246 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.973305 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4223  hypothetical protein  25.15 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.15123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4143  hypothetical protein  25.15 
 
 		 263 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00393741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  25.42 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.54 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4119  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.15 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  26.14 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1924  hypothetical protein  30.7 
 
 		 237 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.240204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  23.45 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  23.93 
 
 		 268 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>