30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2016 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  440  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  57.14 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  59.91 
 
 		 211 aa  247  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  58.02 
 
 		 228 aa  243  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  52.63 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  34.56 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  26.36 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  31.62 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  27.74 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  27.14 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  27.52 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.18 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  27.34 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  32.35 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  29.49 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.87 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  26.62 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  23.27 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  24.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  25.58 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4094  hypothetical protein  26.76 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  25.34 
 
 		 242 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  26.47 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>