29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1895 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  33.01 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  30.62 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  39.58 
 
 		 180 aa  95.5  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  29.26 
 
 		 229 aa  92.8  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  33.1 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  30.3 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  30.91 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  32.09 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  28.97 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  30.56 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  35.71 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  38.3 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  37.11 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  26.18 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  25.25 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  28.19 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  27.45 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  24.75 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.34 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  29.13 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  25.95 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  28.07 
 
 		 228 aa  42  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>