24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1633 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  42 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  42.65 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  36 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  28.23 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  30.53 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  33.57 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  29.73 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  31.45 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  29.53 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  24.86 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  30.89 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  25.52 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 180 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  27.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  43.18 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  26.52 
 
 		 171 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>