29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1043 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  46.46 
 
 		 199 aa  170  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  44.66 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  36 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  40.09 
 
 		 212 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  38.12 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  33 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  30.3 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  33.53 
 
 		 164 aa  94.7  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  32.63 
 
 		 176 aa  94.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  33.16 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  31.05 
 
 		 176 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  34.39 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  33.54 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  37.58 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  30.14 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  28.78 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.86 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  32 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  27.11 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  32.87 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  33.57 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  27.45 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  24.87 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  34.13 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  24.16 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  31.5 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  26.06 
 
 		 205 aa  42  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>