19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2608 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  57.14 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  53.88 
 
 		 228 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  64.2 
 
 		 211 aa  216  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  52.29 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  30.62 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  33.85 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  31.62 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  24.18 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  24.35 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  30.37 
 
 		 176 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  25.48 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  25.39 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  26.06 
 
 		 193 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>