30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2493 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  45.37 
 
 		 212 aa  181  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  43.48 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  42.72 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  42.65 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  42.21 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  43.84 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  42.42 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  37.27 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  38.38 
 
 		 176 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  36.59 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  39.87 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  35.41 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  34.63 
 
 		 191 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  42.21 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  34.39 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  30.39 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  29.85 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  30.32 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  28.21 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  26.87 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  28.57 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  27.81 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  29.37 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  29.8 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  33.8 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.49 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.61 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  29.89 
 
 		 187 aa  44.7  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>