25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3165 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 180 aa  357  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  39.58 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  30.73 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  37.84 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  27.32 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  29.31 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  26.7 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  36.81 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  32.2 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  31.93 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  29.11 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  29.79 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  29.47 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  25.64 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  27.34 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  29.14 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  27.04 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  26.55 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  20.38 
 
 		 229 aa  44.7  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>