28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3695 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  400  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  38.66 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  38.34 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  37.38 
 
 		 212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  36.55 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  36.6 
 
 		 176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  37.06 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  32.98 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  37.81 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  32.88 
 
 		 220 aa  99.4  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  36.36 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  36.22 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  33.14 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  30.33 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  32.67 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  31.19 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  30.14 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  29.53 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  29.14 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  32.35 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  33.58 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  24.27 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>