20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0818 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  473  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  58.02 
 
 		 212 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  53.88 
 
 		 205 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  63.22 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  50.99 
 
 		 202 aa  155  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  31.6 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  35 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  27.34 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  31.46 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  23.41 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  31.47 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  33.8 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  27.45 
 
 		 176 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  33.58 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2504  hypothetical protein  25.82 
 
 		 273 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.79 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>