33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4713 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  340  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  51.22 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  37.34 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  34.15 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  32.73 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  37.41 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  33.54 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  34.39 
 
 		 198 aa  97.1  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  31.95 
 
 		 220 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  30.46 
 
 		 212 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  33.53 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 		 229 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 		 199 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  32.37 
 
 		 191 aa  87.8  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 205 aa  87  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  28.28 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  34.75 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  32.59 
 
 		 210 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  33.85 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.71 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  27.34 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.74 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  30.43 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  31.67 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  27.19 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  28.68 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  27.33 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  23.31 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.37 
 
 		 238 aa  42  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>