37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4605 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  35.23 
 
 
191 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  37.23 
 
 
176 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  35.45 
 
 
186 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 
212 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  28.38 
 
 
229 aa  99.4  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  31.37 
 
 
198 aa  99.4  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  32.28 
 
 
176 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  32.08 
 
 
164 aa  96.3  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  31 
 
 
199 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 
191 aa  91.3  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  28.93 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  34.97 
 
 
171 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 
180 aa  88.6  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  38.1 
 
 
193 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  38.93 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  32.28 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  35.97 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  27.42 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  35.92 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  28.11 
 
 
212 aa  61.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  28.57 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  32.45 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  28.67 
 
 
212 aa  55.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.26 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  36.47 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  29.76 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  26.67 
 
 
236 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2659  hypothetical protein  33.09 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.928441  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.33 
 
 
211 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3609  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.465458  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4203  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2136  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.72 
 
 
245 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.517564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0368  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6209  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.08 
 
 
251 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>