29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3644 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 229 aa  471  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  45.22 
 
 		 194 aa  202  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  42.17 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  43.48 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  36.68 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  38.53 
 
 		 176 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  32.61 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  32.75 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  33.19 
 
 		 205 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  35.37 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  28.82 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  28.94 
 
 		 192 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  29.89 
 
 		 164 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 		 191 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  28.5 
 
 		 171 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  28.38 
 
 		 191 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  28.8 
 
 		 210 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  24.18 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  44.9 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  24.69 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  26.83 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  29.13 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2789  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  33.98 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  21.2 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  21.56 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>