26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2685 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  53.59 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  45.96 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  37.56 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  36.14 
 
 		 194 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  36.59 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  37.33 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  33.62 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  34.18 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  35.53 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  34.17 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  30.32 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  34.01 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  35.71 
 
 		 164 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  32.37 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  34.81 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  31 
 
 		 191 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  27.18 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  26.34 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  25.74 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  28 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  27.89 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  28.03 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  26.57 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  25.6 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>