30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5805 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5805  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  360  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.053311  normal  0.533619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5725  twin-arginine translocation pathway signal  62.5 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6564  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.126612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4950  twin-arginine translocation pathway signal  40.57 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.203665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5417  twin-arginine translocation pathway signal  42.71 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2493  twin-arginine translocation pathway signal  42.42 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.457593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2475  twin-arginine translocation pathway signal  41.45 
 
 		 194 aa  142  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.624482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3644  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 229 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1736  hypothetical protein  34.09 
 
 		 220 aa  124  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.381646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3695  hypothetical protein  39.73 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.736065  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1966  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000304776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1890  hypothetical protein  36.08 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4689  hypothetical protein  36.46 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.591114  normal  0.0263781 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4605  hypothetical protein  36.27 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2685  twin-arginine translocation pathway signal  34.17 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.261354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00435  Twin-arginine translocation pathway signal  33.01 
 
 		 205 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.546293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4713  hypothetical protein  33.54 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.374995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1043  twin-arginine translocation pathway signal  31.05 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1895  hypothetical protein  32.41 
 
 		 210 aa  90.9  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.803061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5080  twin-arginine translocation pathway signal  33.14 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  0.478678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3165  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.575063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0420  hypothetical protein  34.35 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2016  hypothetical protein  34.56 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1034  acetate--CoA ligase  28.16 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1207  twin-arginine translocation pathway signal  25.13 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0229  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  33.63 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000251954  normal  0.179605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1633  hypothetical protein  24.86 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0818  hypothetical protein  27.45 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2608  hypothetical protein  30.37 
 
 		 205 aa  48.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00101879  normal  0.820547 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2178  hypothetical protein  32.58 
 
 		 187 aa  47.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>