23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6566 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6566  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6280  hypothetical protein  95.43 
 
 		 219 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032529 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5508  hypothetical protein  78.6 
 
 		 216 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108926  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0949  hypothetical protein  55.82 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0775  hypothetical protein  55.38 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0787  hypothetical protein  55.82 
 
 		 280 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0924735  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0466  hypothetical protein  59.18 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6388  hypothetical protein  56.1 
 
 		 220 aa  216  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1287  hypothetical protein  55.83 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.25253 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7244  hypothetical protein  50.74 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0175016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0417  hypothetical protein  55.9 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2086  hypothetical protein  51.79 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0405838 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4193  hypothetical protein  47.29 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1915  hypothetical protein  31 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.577578  normal  0.34771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5468  hypothetical protein  28.86 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3684  hypothetical protein  33.16 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.435578  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0665  thioesterase  39.31 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00890  gluconate dehydrogenase small subunit  29.41 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3645  hypothetical protein  24.85 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.02 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2976  hypothetical protein  23.67 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.522308  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0463  hypothetical protein  30.63 
 
 		 242 aa  42  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0438  hypothetical protein  30.63 
 
 		 242 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.904473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>