More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4688 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4688  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4790  dihydrodipicolinate synthetase  87.74 
 
 		 311 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2224  dihydrodipicolinate synthetase  51.49 
 
 		 309 aa  298  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6101  dihydrodipicolinate synthetase  46.36 
 
 		 317 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3833  dihydrodipicolinate synthetase  44.52 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.214205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  32.2 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  29.66 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  30.08 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0585  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1605  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1632  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1658  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0472  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0673  dihydrodipicolinate synthetase  27.86 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  30.36 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3661  N-acetylneuraminate lyase  21.34 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.529009  normal  0.169481 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3699  N-acetylneuraminate lyase  21.91 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3530  N-acetylneuraminate lyase  21.91 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.224809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3602  N-acetylneuraminate lyase  21.91 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3637  N-acetylneuraminate lyase  21.91 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3532  N-acetylneuraminate lyase  21.91 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28170  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00641704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  24.76 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  21.86 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  23.84 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  26.8 
 
 		 298 aa  62.4  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  26.63 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03085  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0481  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3707  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0487465  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1602  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.216602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4205  dihydrodipicolinate synthetase  27.15 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03036  hypothetical protein  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3551  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.35374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1629  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0481  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.556937 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3520  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0303093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3413  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0759607  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1655  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4542  N-acetylneuraminate lyase  21.38 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  29.94 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  29.03 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0469  dihydrodipicolinate synthetase  27.92 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  30.59 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3391  dihydrodipicolinate synthetase  24.77 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0676  dihydrodipicolinate synthetase  27.41 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  26.63 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0588  dihydrodipicolinate synthetase  27.41 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0515  dihydrodipicolinate synthase  27.17 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442329 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1453  putative dihydrodipicolinate synthase  23.71 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4181  dihydrodipicolinate synthase  28.49 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  24.26 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4615  dihydrodipicolinate synthase  27.98 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.330125  hitchhiker  0.00385635 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  26.9 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  26.19 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  28.8 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0415  N-acetylneuraminate lyase  21.43 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.275578  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  25.32 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0257  dihydrodipicolinate synthase  24.86 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.457936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  23.83 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  26.95 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4793  dihydrodipicolinate synthetase  26.67 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5472  dihydrodipicolinate synthetase  25.73 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3836  dihydrodipicolinate synthetase  27.22 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0965  dihydrodipicolinate synthase  20 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  27.98 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  25.53 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  27.38 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  25.4 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1194  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  hitchhiker  0.000799009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  27.38 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  24.82 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3832  N-acetylneuraminate lyase  24.09 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  25.71 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  27.01 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  25.43 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0992  dihydrodipicolinate synthetase  26.19 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.673974  hitchhiker  0.00851435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  26.53 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  29.07 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1160  dihydrodipicolinate synthetase  25.91 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.340867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  27.38 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4892  dihydrodipicolinate synthase  27.98 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0566089 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  27.5 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2479  dihydrodipicolinate synthetase  24.26 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  28.41 
 
 		 291 aa  53.9  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  23.49 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  24.55 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  25 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1908  dihydrodipicolinate synthase  29.38 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0532  dihydrodipicolinate synthase, putative  22.43 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  28.03 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>