More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5283 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5283  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.29825 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.91 
 
 
282 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270529  normal  0.113224 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7253  ABC transporter  71.63 
 
 
282 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.74 
 
 
275 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.931612  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
282 aa  219  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
278 aa  218  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.48 
 
 
290 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  44.4 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  44.4 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
294 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
281 aa  214  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
289 aa  211  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  42.05 
 
 
298 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
301 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
298 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.28 
 
 
281 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542152 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
298 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  41.29 
 
 
298 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
298 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
292 aa  208  8e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.679353  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  40.38 
 
 
300 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.75 
 
 
298 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40 
 
 
300 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  39.49 
 
 
298 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
301 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1376  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  40.42 
 
 
652 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000369923 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
282 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000739779  decreased coverage  0.0000000000305889 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.197638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
399 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1061  hypothetical protein  41.92 
 
 
280 aa  196  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
278 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281492  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003610  L-proline Glycine Betaine ABC transport system permease protein proW  38.55 
 
 
363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
283 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
295 aa  195  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0552935  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
294 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
276 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  40.75 
 
 
274 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
272 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2844  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  42.7 
 
 
321 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.852577 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.78 
 
 
295 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3282  ABC transporter membrane spanning protein (proline/glycine betaine)  41.11 
 
 
281 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
279 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0079247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0896  glycine betaine transporter membrane protein  37.64 
 
 
392 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.652731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
278 aa  192  6e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01120  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  38.7 
 
 
298 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2824  choline ABC transporter, permease protein  40.91 
 
 
281 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730549  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0615  glycine betaine ABC transporter, binding protein inner membrane component  36.03 
 
 
356 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00230108  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4830  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40 
 
 
283 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.865615 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
277 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5272  histidine ABC transporter, permease protein, putative  40 
 
 
283 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
277 aa  191  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.316827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
317 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.565238  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
400 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24580  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  37.77 
 
 
303 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2929  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter permease  45.35 
 
 
415 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
400 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0842907  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3535  glycine betaine transporter membrane protein  38.18 
 
 
388 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872834  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1060  glycine betaine transporter membrane protein  38.18 
 
 
388 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.51 
 
 
277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1114  glycine betaine transporter membrane protein  38.18 
 
 
388 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  37.36 
 
 
374 aa  189  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
283 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000687252  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3093  choline ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
285 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499951  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
283 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.158267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0864  glycine betaine transporter membrane protein  36.76 
 
 
400 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0381143  normal  0.921004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
293 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00518726  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1789  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.02 
 
 
277 aa  188  7e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
284 aa  188  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2476  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.72 
 
 
357 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4913  choline ABC transporter, permease protein  41.42 
 
 
281 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412098 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2180  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  39.85 
 
 
284 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
383 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
283 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
278 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0320  choline ABC transporter, permease protein  40.96 
 
 
281 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
283 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0363  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.49 
 
 
283 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
283 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
283 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0151467  normal  0.023955 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16981  ABC transporter,membrane component, glycine betaine/proline family protein  41.35 
 
 
304 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3321  glycine betaine transporter membrane protein  37 
 
 
422 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0295  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  40.67 
 
 
281 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.698088  hitchhiker  0.0000339096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3158  glycine betaine transporter membrane protein  36.53 
 
 
355 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
281 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247617  normal  0.0422792 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 
321 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09190  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  40.6 
 
 
294 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.041544  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.29 
 
 
288 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.119845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
409 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>