More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_21500 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_21500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
272 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.12 
 
 
278 aa  364  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000001583  hitchhiker  0.0000000544844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.83 
 
 
281 aa  305  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.112319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.02 
 
 
301 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0739  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  57.89 
 
 
301 aa  295  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.483672  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0691  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  57.89 
 
 
299 aa  295  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.09 
 
 
278 aa  293  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0667053  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2377  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  53.68 
 
 
274 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.336492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0502  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  51.67 
 
 
276 aa  276  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.819479  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.01 
 
 
294 aa  274  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1061  hypothetical protein  52.42 
 
 
280 aa  273  3e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 
292 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.679353  normal  0.0162357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3449  choline ABC transporter, permease protein  50.57 
 
 
301 aa  268  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.18 
 
 
376 aa  267  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.197638  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01120  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  50.55 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26210  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  52.43 
 
 
310 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.16 
 
 
282 aa  264  8.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.99 
 
 
295 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
277 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_003296  RS02042  transmembrane ABC transporter protein  50.19 
 
 
298 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.23 
 
 
294 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0967  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  50.57 
 
 
300 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
289 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0456  ABC glycine betaine/L-proline transporter, inner membrane subunit  49.81 
 
 
298 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.424903  normal  0.0286043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.37 
 
 
278 aa  260  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0116658  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3486  choline ABC transporter, permease protein  49.43 
 
 
298 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.180465 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0902  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.19 
 
 
290 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0808444  normal  0.400177 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1869  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2026  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0565  putative glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.120464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0449  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1932  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.43 
 
 
298 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5108  choline ABC transporter, permease protein  49.43 
 
 
298 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.43 
 
 
298 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00870989  normal  0.647601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24580  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  47.96 
 
 
303 aa  258  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0193054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2815  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  53.7 
 
 
278 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3059  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  50.37 
 
 
321 aa  257  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2548  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  53.7 
 
 
278 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000537684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.14 
 
 
278 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16981  ABC transporter,membrane component, glycine betaine/proline family protein  55.85 
 
 
304 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2497  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  54.28 
 
 
278 aa  256  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0773919  normal  0.709864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4810  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.81 
 
 
298 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 
298 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.669781 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5091  choline ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
298 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1496  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 
451 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0787924  normal  0.370511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.44 
 
 
281 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.542152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2795  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  53.53 
 
 
278 aa  255  6e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
283 aa  254  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.158267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2792  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  53.33 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0105765 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2596  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease  53.33 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2515  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  53.33 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2075  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260591  normal  0.31699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2837  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein  53.7 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.148231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2785  glycine betaine/L-proline ABC transporter permease protein  53.33 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.79114  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2476  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.75 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
283 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
283 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0151467  normal  0.023955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
283 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
400 aa  253  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
400 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0842907  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1615  ABC proline/glycine betaine transporter, inner membrane subunit  49.43 
 
 
300 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5041  choline ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 
300 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.503755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
317 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.565238  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.79 
 
 
281 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0874142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2929  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter permease  53.74 
 
 
415 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
283 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1902  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
276 aa  248  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00849188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.76 
 
 
399 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00496589  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.44 
 
 
279 aa  246  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09190  ABC-type proline/glycine betaine transport system, permease component  48.33 
 
 
294 aa  245  6e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.041544  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1796  amino acid ABC transporter, permease protein  46.84 
 
 
575 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.135141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3734  glycine betaine transporter membrane protein  47.74 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0615  glycine betaine ABC transporter, binding protein inner membrane component  49.25 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00230108  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1060  glycine betaine transporter membrane protein  48.87 
 
 
388 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1114  glycine betaine transporter membrane protein  48.87 
 
 
388 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0864  glycine betaine transporter membrane protein  47.74 
 
 
400 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 
307 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3535  glycine betaine transporter membrane protein  48.87 
 
 
388 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.872834  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
278 aa  242  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.177643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3477  glycine betaine transporter membrane protein  48.5 
 
 
400 aa  242  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3282  ABC transporter membrane spanning protein (proline/glycine betaine)  50.19 
 
 
281 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3321  glycine betaine transporter membrane protein  48.12 
 
 
422 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3158  glycine betaine transporter membrane protein  47.39 
 
 
355 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.363018  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0079247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3093  choline ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.499951  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2824  choline ABC transporter, permease protein  48.18 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730549  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 
278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003610  L-proline Glycine Betaine ABC transport system permease protein proW  47.37 
 
 
363 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.07 
 
 
283 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.19 
 
 
277 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.316827  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0112  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.06 
 
 
277 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281492  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_004310  BR1580  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease protein, putative  47.23 
 
 
278 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8402  choline ABC transporter, permease protein  48.13 
 
 
285 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
327 aa  237  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00444085  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.81 
 
 
409 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.584645  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 
284 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>