124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0080 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0080  collagen triple helix protein  100 
 
 		 107 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000587226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  70.37 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  71.79 
 
 		 369 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  75.71 
 
 		 380 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  75.36 
 
 		 445 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  75 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  75 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  54 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  76.71 
 
 		 462 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  66.67 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  73.61 
 
 		 639 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  70.83 
 
 		 1055 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  73.61 
 
 		 1219 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  69.01 
 
 		 469 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  75 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  69.01 
 
 		 647 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  65.28 
 
 		 300 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  54.84 
 
 		 240 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  70 
 
 		 815 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  54.84 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  73.13 
 
 		 348 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  57.53 
 
 		 717 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  75 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  66.67 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  55.81 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  69.57 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  55.91 
 
 		 706 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.63 
 
 		 1168 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  64.29 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  67.61 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2199  collagen-like protein  73.02 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.76687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  55.91 
 
 		 748 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  52.53 
 
 		 936 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  73.02 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  61.43 
 
 		 523 aa  61.6  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  71.88 
 
 		 285 aa  60.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  67.95 
 
 		 606 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  64.29 
 
 		 1147 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  74.14 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  59.72 
 
 		 867 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  73.21 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  59.74 
 
 		 813 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  51.76 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  65.71 
 
 		 1451 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  62.67 
 
 		 712 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  73.33 
 
 		 360 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  61.43 
 
 		 643 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  58.57 
 
 		 474 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  59.72 
 
 		 585 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 473 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  42.5 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52 
 
 		 582 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  58.33 
 
 		 835 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  62.34 
 
 		 512 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  54.88 
 
 		 481 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  54.88 
 
 		 478 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  54.93 
 
 		 842 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  55.07 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  47.3 
 
 		 400 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  50.68 
 
 		 1426 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2450  hypothetical protein  70.18 
 
 		 366 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  51.81 
 
 		 835 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 582 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50.7 
 
 		 468 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  51.43 
 
 		 439 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  53.42 
 
 		 835 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  40.82 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 587 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  48.61 
 
 		 437 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  50 
 
 		 645 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  46.48 
 
 		 542 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  51.43 
 
 		 451 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  51.43 
 
 		 437 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  51.43 
 
 		 437 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4887  collagen triple helix repeat protein  50.62 
 
 		 305 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  47.37 
 
 		 382 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.61 
 
 		 2914 aa  50.8  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  51.25 
 
 		 1873 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  53.42 
 
 		 934 aa  50.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  62.5 
 
 		 1580 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  48.61 
 
 		 466 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  66.13 
 
 		 437 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2281  hypothetical protein  51.69 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4423  triple helix repeat-containing collagen  50.49 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000283888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  67.8 
 
 		 435 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4764  hypothetical protein  75 
 
 		 249 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0280415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1694  triple helix repeat-containing collagen  78.72 
 
 		 1148 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1759  collagen triple helix repeat protein  55.43 
 
 		 237 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.752553  normal  0.788316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  56.72 
 
 		 838 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  41.67 
 
 		 298 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  53.42 
 
 		 1297 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  43.84 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3507  collagen triple helix repeat protein  58.23 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50.7 
 
 		 434 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4893  collagen triple helix repeat protein  54.55 
 
 		 230 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 951 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  58.06 
 
 		 1321 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  43.84 
 
 		 319 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  45.07 
 
 		 493 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1259  hypothetical protein  44.04 
 
 		 403 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.459414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>