More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5440 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5440  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641529  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1522  hypothetical protein  46.34 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  46.58 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  45.51 
 
 		 336 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  47.42 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.89 
 
 		 328 aa  262  6e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.45 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.75 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.88 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.68 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.75 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.3 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.19 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  40.5 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.58 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.6 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.06 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  42.95 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.1 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.26 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.93 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.15 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  44.63 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  39.88 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.15 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.15 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  40.61 
 
 		 337 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.91 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.28 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  41.37 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.47 
 
 		 328 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.16 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  41.36 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.58 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  40.72 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.43 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.45 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  41.64 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  42.96 
 
 		 335 aa  243  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.6 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.74 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.93 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  40.75 
 
 		 339 aa  241  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.1 
 
 		 325 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  41.89 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.78 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  39.26 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.57 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.92 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  40 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.61 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.39 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  41.24 
 
 		 349 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  38.96 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  39.53 
 
 		 356 aa  238  8e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  41.25 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.27 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  39.18 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.2 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.2 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  39.32 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.53 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  43.1 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  41.28 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.53 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  39.87 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.16 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  40 
 
 		 329 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  40.7 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.14 
 
 		 327 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.34 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  38.8 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.06 
 
 		 328 aa  235  8e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40 
 
 		 344 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  39.26 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.37 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.13 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 		 331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  37.62 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.95 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  39.35 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.8 
 
 		 335 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  39.66 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.82 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.41 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.33 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  40.26 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  37.66 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  39.86 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  42.3 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38.85 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  40.12 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  39.57 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  40.68 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  38.59 
 
 		 343 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>