140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5274 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  71.43 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  42.06 
 
 		 374 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  38.22 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  37.5 
 
 		 361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  35.91 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  38.04 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  37.5 
 
 		 361 aa  206  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  38.04 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  27.69 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  30.37 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  30.37 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.33 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  30 
 
 		 360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  28.62 
 
 		 338 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  28.01 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.06 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.07 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  29.01 
 
 		 343 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  29.93 
 
 		 362 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  26.73 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  29.93 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  29.01 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  28.57 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  26.73 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  26.14 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  25.86 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.33 
 
 		 344 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  28.83 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  25.96 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.2 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  27.24 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.97 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  29.91 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  29.31 
 
 		 330 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  27.95 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  28.26 
 
 		 356 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  28.47 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  29.84 
 
 		 335 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  28.34 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  89  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  24.17 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  27.53 
 
 		 308 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  26.93 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  24.82 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  27.19 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  27.73 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  25.89 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  25.09 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.76 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  25.3 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  29.03 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  28.82 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  27.59 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  25.4 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  26.67 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  24.37 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  27.56 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.83 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  30.34 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  26.1 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  24.7 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  26.35 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  25.98 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  24.92 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  23.47 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  23.74 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  24.83 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  30.52 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  30.52 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  23.62 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  26.13 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  27.51 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  25.78 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  26.91 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  21.67 
 
 		 321 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  26.91 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  26.91 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  26.13 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  25.16 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  26.91 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  26.91 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  26.91 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  28.14 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  24 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  30.05 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  26.91 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  26.64 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  26.64 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  26.74 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.59 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  26.1 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.86 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  23.49 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>