155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2506 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  94.1 
 
 
356 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  92.13 
 
 
356 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  94.1 
 
 
356 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  100 
 
 
356 aa  725    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  82.3 
 
 
356 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  59.88 
 
 
330 aa  395  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  35.63 
 
 
363 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  34.9 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  35.42 
 
 
354 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  36.1 
 
 
363 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.51 
 
 
343 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  34.44 
 
 
366 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.73 
 
 
364 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.46 
 
 
344 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  33.61 
 
 
366 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  36.81 
 
 
388 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  33.89 
 
 
366 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  33.63 
 
 
366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  33.89 
 
 
366 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  34.2 
 
 
366 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  33.33 
 
 
366 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  35.28 
 
 
366 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  34.34 
 
 
329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  35.19 
 
 
337 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  33.43 
 
 
336 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  33.88 
 
 
338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  35.55 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  32.61 
 
 
348 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  34.02 
 
 
427 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  32.83 
 
 
351 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  32.51 
 
 
348 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  32.82 
 
 
367 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  31.86 
 
 
362 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.52 
 
 
388 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  33.24 
 
 
369 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.46 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.68 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  33.13 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  31.03 
 
 
335 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  31.38 
 
 
361 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  31.65 
 
 
357 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  32.83 
 
 
358 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.18 
 
 
349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  31.12 
 
 
349 aa  135  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.5 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.37 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  30.65 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  30.65 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  30.61 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  30.61 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  29.86 
 
 
488 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  30.61 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  30.65 
 
 
331 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.09 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.79 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  27 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  31.4 
 
 
361 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  31.16 
 
 
341 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  31.4 
 
 
361 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  31.4 
 
 
361 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  30.79 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.22 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.66 
 
 
385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  31.12 
 
 
353 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  30.74 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.11 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  30.91 
 
 
353 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  31 
 
 
311 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.79 
 
 
337 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  32.26 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.88 
 
 
338 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  29.75 
 
 
335 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  29.07 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  30.31 
 
 
335 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  31.85 
 
 
341 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  30.45 
 
 
341 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  29.75 
 
 
335 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  26.46 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  27.44 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  27.66 
 
 
356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  27.44 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  27.91 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  31.51 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.32 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  32.14 
 
 
340 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  28.81 
 
 
335 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  30.28 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  30.56 
 
 
335 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>