154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0947 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  100 
 
 		 370 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  72.73 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  72.73 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  72.73 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  72.44 
 
 		 361 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  72.44 
 
 		 361 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  72.44 
 
 		 361 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  67.6 
 
 		 357 aa  498  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  72.3 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  65.92 
 
 		 358 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  68.44 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  61.81 
 
 		 362 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  58.95 
 
 		 358 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  56.25 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  55.05 
 
 		 353 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  53.37 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  57.14 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  53.07 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  54.83 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  53.07 
 
 		 331 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  53.58 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  53.58 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  53.58 
 
 		 349 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  53.72 
 
 		 311 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  54.12 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  46.27 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  46.27 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  45.96 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  44.34 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  39.39 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  40.12 
 
 		 337 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  39.94 
 
 		 388 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  42.39 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  39.94 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  43.09 
 
 		 427 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.1 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  41.25 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  40.13 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  39.8 
 
 		 348 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  43.08 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  39.45 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.03 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  37.08 
 
 		 492 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  36.8 
 
 		 481 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  39.26 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  36.11 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  36.11 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  36.11 
 
 		 492 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  35.81 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.55 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  29.36 
 
 		 356 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.8 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  30.67 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  30.67 
 
 		 356 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  30.37 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  29.75 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.33 
 
 		 344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  48.63 
 
 		 456 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  27.09 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  32.44 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  32.23 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  28.48 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  31.65 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  32.23 
 
 		 338 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  32.23 
 
 		 366 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  30.94 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  29.67 
 
 		 366 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  29.89 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  30.62 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.94 
 
 		 356 aa  106  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  30.23 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.94 
 
 		 343 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  28.77 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.5 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  28.29 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  25.39 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3126  hypothetical protein  29.87 
 
 		 332 aa  99.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0272952  normal  0.0855936 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3482  hypothetical protein  29.25 
 
 		 332 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.71 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  26.83 
 
 		 309 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  30.2 
 
 		 336 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  28.37 
 
 		 341 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  28.48 
 
 		 327 aa  95.9  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  28.48 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  28.48 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  23.53 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  30.12 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  30.12 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.81 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  27.62 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  27.62 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  25.76 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  26.4 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>