146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3077 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  717    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  33.8 
 
 
356 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  34.01 
 
 
356 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  33.72 
 
 
356 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  33.24 
 
 
356 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  33.43 
 
 
356 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  34.59 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.65 
 
 
343 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  32.69 
 
 
329 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.31 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  33.84 
 
 
388 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  34.08 
 
 
330 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  31.48 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  30.99 
 
 
363 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  33.15 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  31.49 
 
 
366 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  32.6 
 
 
366 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  30.97 
 
 
348 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  30.12 
 
 
328 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  32.32 
 
 
366 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  32.32 
 
 
366 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  30.65 
 
 
348 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  29.36 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  33.06 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3031  hypothetical protein  32.94 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586945  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  32.6 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  31.22 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  30.18 
 
 
335 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  29.81 
 
 
366 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  32.04 
 
 
366 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  31.94 
 
 
336 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  30.03 
 
 
357 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  30.24 
 
 
362 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  31.94 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  31.82 
 
 
335 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  30.18 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.04 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.08 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  27.48 
 
 
321 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  29.33 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  29.18 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.14 
 
 
349 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  25.68 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  31.14 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  29.43 
 
 
358 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  28.79 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.31 
 
 
337 aa  93.2  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  29.33 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  28.18 
 
 
351 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  31.65 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  30.21 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.63 
 
 
349 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.53 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.57 
 
 
332 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.91 
 
 
332 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  25.5 
 
 
343 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  25.5 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  29.41 
 
 
317 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  30.03 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5983  type VI secretion protein  30.86 
 
 
377 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  29.79 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  25.37 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  28.21 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.4 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  29.07 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  29.43 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  26.99 
 
 
309 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  31.1 
 
 
337 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  29.43 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  26.01 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  29.07 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  26.01 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  29.07 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  24.67 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  28.4 
 
 
361 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  24.67 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.81 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  24.84 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  26.9 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  27.72 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  25 
 
 
332 aa  82  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  29.03 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  27.22 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  30.66 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  32.23 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  32.23 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  32.23 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  32.23 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  32.23 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  32.23 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  30.86 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>