144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1360 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1360  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.73813  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  99.41 
 
 		 341 aa  698    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1472  type VI secretion protein  99.71 
 
 		 341 aa  698    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  52.45 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  52.15 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  52.45 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  52.45 
 
 		 349 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  51.67 
 
 		 353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  49.85 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  46.73 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  45.91 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  46.27 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  45.45 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  45.45 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  47.04 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  47.04 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  47.04 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  45.45 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  45.94 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  47.04 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  47.04 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  47.04 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  44.38 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  44.38 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  45.65 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  42.19 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  46.88 
 
 		 311 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2588  hypothetical protein  42.01 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.695142  normal  0.103475 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.99 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  39.66 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  38.99 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  38.01 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  40.77 
 
 		 337 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  36.81 
 
 		 427 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  36.22 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  36.45 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  39.67 
 
 		 367 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  36.31 
 
 		 488 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  35.56 
 
 		 492 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  34.45 
 
 		 481 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  37.3 
 
 		 377 aa  172  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.85 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  36.96 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  37.38 
 
 		 348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.23 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  43.45 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  43.45 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  43.45 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  43.45 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.37 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  28.08 
 
 		 356 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.97 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.18 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  31.51 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  36.61 
 
 		 329 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  30.48 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  28.67 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  30.14 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  29.45 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  31.51 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.5 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.14 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  26.39 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  26.04 
 
 		 366 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.78 
 
 		 337 aa  90.1  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  26.62 
 
 		 366 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  26.26 
 
 		 366 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  26.26 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.8 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  26.04 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  26.26 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  26.71 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.03 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  26.71 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  26.02 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0758  hypothetical protein  28.21 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.300158  normal  0.0515134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  26.62 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  26.6 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3560  type VI secretion protein  27.84 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3431  hypothetical protein  27.84 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  28.28 
 
 		 335 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.11 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  31.52 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  27.11 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  30.98 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  28.63 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.11 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  27.27 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  24.32 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  25.86 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  29.02 
 
 		 363 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  27.06 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>