153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2959 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  733    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  96.17 
 
 
366 aa  698    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  96.45 
 
 
366 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  81.15 
 
 
364 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  77.87 
 
 
366 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  78.14 
 
 
366 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  77.32 
 
 
366 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  77.05 
 
 
366 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  76.78 
 
 
366 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  76.78 
 
 
366 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  76.63 
 
 
338 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  57.07 
 
 
363 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  50.95 
 
 
363 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  48.37 
 
 
354 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  35.92 
 
 
356 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  34.72 
 
 
356 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  34.44 
 
 
356 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  34.17 
 
 
356 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  34.17 
 
 
356 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  34.71 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.64 
 
 
328 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.94 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.46 
 
 
359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  32.39 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.86 
 
 
344 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  31.7 
 
 
337 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  32.37 
 
 
348 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  32.05 
 
 
348 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.21 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  29.85 
 
 
329 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  34.36 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  34.36 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  34.36 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  34.36 
 
 
340 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  28.17 
 
 
335 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  34 
 
 
348 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  34.36 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.05 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  33.68 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  31.12 
 
 
351 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  30.61 
 
 
361 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  31.56 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  31.22 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  28.53 
 
 
329 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  29.05 
 
 
388 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  29.33 
 
 
357 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  27.61 
 
 
338 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  29.67 
 
 
311 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  29.67 
 
 
331 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  29.67 
 
 
331 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.57 
 
 
346 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.62 
 
 
370 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  26.75 
 
 
332 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  29.27 
 
 
331 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.36 
 
 
332 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  24.2 
 
 
335 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  30.04 
 
 
357 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  27.2 
 
 
358 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  27.71 
 
 
362 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.52 
 
 
332 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  30.95 
 
 
354 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.26 
 
 
385 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  30.29 
 
 
341 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  27.93 
 
 
351 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  26.43 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.83 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  28.14 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  26.12 
 
 
338 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.22 
 
 
337 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.3 
 
 
325 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  30.88 
 
 
427 aa  92.8  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  28.21 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  26.12 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  29.29 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  31.1 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  25.96 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  29.29 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  31.1 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  29.29 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  31.1 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  29.29 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  26.3 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6045  hypothetical protein  30.62 
 
 
336 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  31.1 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  31.1 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  31.1 
 
 
361 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  28.23 
 
 
335 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  24.33 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  24.85 
 
 
356 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  24.85 
 
 
343 aa  89.7  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  27.35 
 
 
353 aa  89.4  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  29.77 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2448  hypothetical protein  31.12 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00427442  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  27.62 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  25.37 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>