142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2803 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  100 
 
 
337 aa  683    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  88.72 
 
 
332 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  88.72 
 
 
332 aa  608  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  52.65 
 
 
356 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  54.05 
 
 
343 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  50.14 
 
 
362 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  52.27 
 
 
362 aa  322  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  51.61 
 
 
338 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  46.67 
 
 
360 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  46.39 
 
 
360 aa  315  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  46.39 
 
 
360 aa  315  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  50.33 
 
 
328 aa  292  6e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  47.83 
 
 
317 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  46.79 
 
 
335 aa  288  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  43.57 
 
 
337 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  39.51 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  39.2 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  39.2 
 
 
338 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  39.26 
 
 
338 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  38.14 
 
 
332 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  37.14 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  41.7 
 
 
308 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  37.62 
 
 
335 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  38.66 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  41.4 
 
 
335 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  39.06 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  35.79 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  34.02 
 
 
335 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  35.45 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.87 
 
 
343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.79 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  26.97 
 
 
356 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  28.79 
 
 
356 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  28.98 
 
 
337 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  28.65 
 
 
356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  29.57 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  28.01 
 
 
351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  28.37 
 
 
356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.46 
 
 
385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  28.18 
 
 
356 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  30.9 
 
 
329 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  29.54 
 
 
388 aa  116  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  32.14 
 
 
366 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  28.62 
 
 
354 aa  115  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.01 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  29.84 
 
 
328 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0739  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.876468  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0609  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0735963  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0720  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.2482  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2128  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.596577  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2030  hypothetical protein  28.9 
 
 
348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23868  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1678  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0539  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  27.01 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  30.09 
 
 
366 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  27.01 
 
 
361 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  27.01 
 
 
361 aa  108  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  27.8 
 
 
330 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  26.69 
 
 
361 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  29.55 
 
 
366 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  32.54 
 
 
349 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  29.79 
 
 
366 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  29.91 
 
 
366 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  29.18 
 
 
366 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  27.8 
 
 
361 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.51 
 
 
346 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  28.06 
 
 
349 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  29.18 
 
 
366 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  31.02 
 
 
348 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  28 
 
 
353 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  29.73 
 
 
338 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  27.11 
 
 
363 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  28.11 
 
 
349 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  28.11 
 
 
349 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  28.11 
 
 
349 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  30.61 
 
 
348 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  26.46 
 
 
374 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  27.22 
 
 
331 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  28.23 
 
 
311 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  27.22 
 
 
331 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  27.27 
 
 
357 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  26.53 
 
 
362 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  30.69 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  26.9 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  27.04 
 
 
427 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  26.3 
 
 
365 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  28.32 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.12 
 
 
349 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  28.22 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.73 
 
 
349 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.81 
 
 
370 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  25.31 
 
 
369 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.47 
 
 
359 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>