138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3244 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3244  type VI secretion protein  100 
 
 		 365 aa  745    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0801  hypothetical protein  54.08 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2994  hypothetical protein  54.35 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000723693 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2586  type VI secretion protein  54.08 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.385239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2488  hypothetical protein  54.08 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1801  hypothetical protein  51.23 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0539966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3658  type VI secretion protein  36.49 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.44997  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5274  hypothetical protein  35.91 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0636  hypothetical protein  34.06 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  29.69 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  28.57 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  28.57 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  29.56 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1226  hypothetical protein  27.41 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1107  type VI secretion protein, family  27.41 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  29.27 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  29.27 
 
 		 360 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  29.27 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2123  hypothetical protein  28.8 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  27.67 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  29.34 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.81 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  25.57 
 
 		 332 aa  99.8  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2910  ImpA domain-containing protein  68.66 
 
 		 791 aa  97.4  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.3 
 
 		 337 aa  96.3  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0049  hypothetical protein  25.73 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  23.99 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1200  hypothetical protein  24.03 
 
 		 337 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5585  hypothetical protein  29.47 
 
 		 308 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2819  hypothetical protein  27.1 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  29 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  24.1 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  28.63 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  24.61 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0027  hypothetical protein  26.51 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.273219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  28.22 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  27.68 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  29.55 
 
 		 427 aa  86.7  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0096  hypothetical protein  29.36 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  29.89 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  24.47 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5426  hypothetical protein  28.98 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  28.7 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000026  hypothetical protein  23.58 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  28.03 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  27.7 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.9 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  27.99 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.3 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2547  hypothetical protein  25.28 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0186955  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  26.06 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  26.06 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  28.09 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  25.99 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  26.21 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  26.47 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  26.06 
 
 		 357 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  27.24 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  27.24 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  26.75 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  28.03 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  27.05 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  23.47 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  26.87 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  27.62 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  26.4 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.41 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  23.78 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  26.42 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  25.42 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  25.39 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  27.08 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  24.39 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  26.1 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  25 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  23.96 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34000  hypothetical protein  27.71 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.375961  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  26.24 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2891  hypothetical protein  27.71 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  23.16 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  23.33 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  23.33 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  23.33 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  24.91 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  25.64 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0865  hypothetical protein  26.49 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.839785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  28.46 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  27.76 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  25.33 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  25.26 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  25.26 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  25.33 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  25.33 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  25.26 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  27.32 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0408  hypothetical protein  27.14 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  27.14 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  27.14 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  27.14 
 
 		 492 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>